二代测序NGS实验室,是一种用于基因检测(高通量测序检测)的实验室,建设二代测序NGS实验室的重点,主要在设计布局分区、 结构材料、气压调节、消毒、照明、传递窗几个方面。
一、二代测序NGS实验室的设计布局分区
二代测序NGS实验室的设计分区,主要将实验室划分为4个区域,即:试剂准备区、标本与文库制备区、文库扩增与检测区、测序区。
1. 试剂准备区
NGS实验室试剂准备区的区域功能及仪器配备如下:
(1)区域功能:用于实验项目所需试剂的配制、分装和保存。
(2)仪器配备:必须配备加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯、超净工作台等仪器设备。
2. 标本与文库制备区
NGS实验室标本与文库制备区的区域功能及仪器配备如下:
(1)区域功能:用于血液处理、血浆制备、DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、DNA浓度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。
(2)仪器配备:必须配备冷冻离心机、微量台式离心机、掌上三管离心机、涡旋震荡器、垂直混合仪、移液器、可移动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、Qubit 2.0核酸定量仪、电脑(可连接互联网)、条形码打印机、普通打印机、扫描枪、磁力架等仪器设备。
3. 文库扩增与检测区
NGS实验室文库扩增与检测区的区域功能及仪器配备如下:
(1)区域功能:用于文库构建后的PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混合后的质检分析。
(2)仪器配备:必须配备PCR仪、QPCR仪、Qubit2.0核酸定量仪、可移动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等仪器设备。
4. 测序区
NGS实验室测序区的区域功能及仪器配备如下:
(1)区域功能:用于测序模板制备,如乳液PCR与磁珠富集回收,以及上机测序、数据分析、报告审核及发放。
(2)仪器配备:必须配备高通量测序仪、PC电脑、打印机、UPS、恒温金属浴、纯水仪、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可移动紫外灯、磁力架、PCR仪等仪器设备。
二、二代测序NGS实验室的主体结构材料
二代测序NGS实验室设计家装要以彩钢板与铝合金材料为主体家装材料,室内阴角与阳角采用铝合金50内圆角铝,这样做的好处是内部结构牢固、密封性好,且不易污染、积尘。
三、二代测序NGS实验室的气压调节
二代测序NGS实验室在气压调节上,要在实验区的外墙和各扇门上安装风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。
四、二代测序NGS实验室的消毒与照明
在消毒上,二代测序NGS实验室的实验区、缓冲区顶部、传送窗内部要配备用于消毒的紫外灯。如果要对实验桌进行局部消毒,还要配备移动紫外线灯;在照明上,照明设备必须不积尘、易清洁才行,这里SAREN三仁建议配备净化灯具。
五、二代测序NGS实验室的传递窗
传递窗分为机械连锁型与电子连锁型,二代测序NGS实验室设计家装建议配备前者,以便确保样本与试剂在传递过程中不会受到污染。
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